这一边，跟随这不良少年的御坂美琴看到一出好戏，一个身穿研究员或是医生专用白大褂的少女仅仅是用言语和演技以及一点麻醉药就将几个不良完全制服。
“呀，真是让我看到十分精彩的东西啦，原本还想要是有个万一我就出手的。”
而少女只是看着御坂美琴：“你就是···【素体】吧。”
“想必你也有所耳闻吧。”少女没有管御坂美琴的惊愕，只是自己说自己的。
御坂美琴想起了有关自己克隆人的传闻，但是，对此她是不相信的，除了幼年时交出去的一份DNA图谱，她可没有给其他任何人她的DNA信息。
“还以为你要说什么呢，想不到长点上机学院也有好八卦的人啊。于是，你对那些传闻知道些什···”
碰，少女直接拿手中的包砸了御坂美琴一下。“你是初中生，而我是高中生，好好遵循长幼之序。InBrief，禁止使用简语。”
“关于那一则传闻请问您是否知晓些什么？”御坂美琴不得不低头，毕竟少女说的是事实。
“知道的比你多，不过比起我在的时候，现在的实验目的及内容好像已经截然不同了。”
“啊？”
“知道了也只是徒增苦恼，因为凭你的能力什么都做不到。我能做到的也微乎其微，发放储蓄卡也只是其中一个环节——灭掉学院都市的死角。通过发放储蓄卡，让人们注意到监视器无法监视到的小路小巷，如此做，或许能阻止本应该在那些地方发生的实验。But，连我本人都被目击到，还被尾随至此，实属大意。”少女转过身，从抽屉里掏出一个文件，“这东西要是被人看见了，可能会变得麻烦起来，看来不能用这些会留下痕迹的东西啊。”说着，从口袋里掏出了打火机，将手中的文件点燃。
“你这都在说些什么，你到底又知道···”御坂美琴急迫上前，却使得燃烧的文件掉落在地上，即将引起一场不小的火灾。
“总之，先把他们带出去。”说着，御坂美琴开始拖动几个倒地的不良少年，而少女则是迅速地披上白大褂，离开了。
御坂美琴也想追上去，但这些不良少年可能会被烧死，善良的御坂美琴还无法视人命于无物。
离开这个地方后，御坂美琴始终无法相信自己克隆人的存在，但是那股心中的不安让她决定查一查那个少女，而就是这个决定让她彻底滑向深渊。
在路边公用电话亭内，御坂美琴用自己的能力直接入侵书库查看长点上机学院的学生信息，很快找到了那个少女的信息。
“布束砥信，高中三年级学生，十七岁，幼年时便在生物精神医学领域锋芒毕露，在山下大学附属医院以及樋口制药·第七医药学研究中心···”看到这里，御坂美琴已经有些相信布束砥信的话语了，当初御坂美琴交出DNA图谱的时候，就是在山下大学附属医院。
看完布束砥信信息后，御坂美琴下定决心潜入樋口制药·第七医药学研究中心探查。
在一处商店买好便装之后，御坂美琴随意找了一家酒店，换好衣服后来到了樋口制药·第七医药学研究中心，然后利用自己的能力潜入了最机密区域，发现了这样一份报告。
“超电磁炮量产计划：【Sisters】最终报告书。”
看完之后，御坂美琴顿时感到一阵轻松，自己的克隆实验确实存在没错，而且当初自己的DNA一开始就是被骗去做克隆实验的，但是，经过【树状图设计者】的计算这项计划有致命缺陷，已经终止并永久冻结了。
“什么嘛，到头来还是没有我的克隆体嘛，一定是这个疯狂的计划泄漏出来的时候就不完整，传闻不胫而走罢了。”御坂美琴像是放下了包袱了一样轻松地离开了，却是没有想到，仅仅在她离开后不久，一个和她长得一样的人就走了过来，将关于【Sisters】的档案完全删除。
而少女自称御坂。
另一边，佐天泪子来到了属于暗部Protect的基地，在这里，她见到了之前听过的春上衿衣的老师木山春生，有固法美伟的男友也是曾经大蜘蛛首领的黑妻绵流，自己的同居者，也是学院都市Level5心理掌握的食蜂操祈，还有一位不认识的美少女。
然后，在这群人之后，是自己的男友，亦是学院都市Level5的白井月。
“泪子，我现在要和你说的是关于存在于这个世界的真实，这个学院都市的真正面目，还有我的真正面目。”白井月顿了一下，接着说着。“听完我说完后，你再好好决定是否真的要到‘这边’来。”
“这个世界分成四个部分：其中普通人的世界是一部分，他们没有任何异常的能力，只是生活在这个世界上；第二部分是【科学侧】，没错，就是以学院都市为代表的超能力者以及以科学为名的武装集团；第三部分则是【魔法侧】。”
“魔法？真的有那种东西？”
“有的，既然超能力存在那么为什么魔法不存在？而且魔法的势力远远比超能力更加庞大，有着二十亿信徒的十字教就是最大的一部分。这个世界【魔法侧】主要分三个势力，罗马正教、俄罗斯成教和英国清教。而且，【魔法侧】和【科学侧】是对立的。”
“对立？为什么？”
“十字教是建立在神与耶稣存在的基础上的，但是科学否定神的存在，相当于否定了魔法存在的意义。所以二者的矛盾基本上不可调和。”
停了一下，给佐天泪子一点消化的时间，白井月继续说着：“这个世界的第四部分势力是天朝的【修真侧】。他们是中立的势力，至于具体【修真侧】是什么意思，就不用太在意了。”
佐天泪子细细地想着刚刚所听到的话语，她第一次接触到这样的现实，实际上，暗部Protect的其他人也是第一次听到这些信息。食蜂操祈或许有些了解，但没有这样细致的分类。
“但是，月你还是没有和我说清楚御坂同学的事情。”佐天泪子没有忘记自己的最初目的。
“别急，关于这个学院都市，还有不少要和你说呢。”